Theo đó, Nghị định cũng quy định miễn thuế xuất, nhập khẩu đối với nhiều mặt hàng, cụ thể:

1. Hàng hoá của tổ chức, cá nhân nước ngoài được hưởng quyền ưu đãi, miễn trừ; Hành lý của người xuất cảnh, nhập cảnh; Tài sản di chuyển; quà biếu, quà tặng; Hàng hóa mua bán, trao đổi của cư dân biên giới; Hàng hóa nhập khẩu để gia công, sản phẩm gia công xuất khẩu; Hàng hóa nhập khẩu để sản xuất hàng hóa xuất khẩu; Hàng hóa tạm nhập, tái xuất hoặc tạm xuất, tái nhập trong thời hạn nhất định; Hàng hóa nhập khẩu để tạo tài sản cố định của đối tượng được hưởng ưu đãi đầu tư.

2. Nghị định cũng quy định miễn thuế nhập khẩu đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện trong thời hạn 5 năm; Hàng hóa nhập khẩu phục vụ hoạt động dầu khí; Hàng hóa nhập khẩu phục vụ hoạt động đóng tàu, tàu biển xuất khẩu; Giống cây trồng, giống vật nuôi, phân bón, thuốc bảo vệ thực vật; Hàng hóa nhập khẩu phục vụ nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ; Hàng hóa nhập khẩu phục vụ trực tiếp cho an ninh, quốc phòng; Hàng hóa nhập khẩu phục vụ trực tiếp cho giáo dục; hàng hóa sản xuất, gia công, tái chế, lắp ráp tại khu phi thuế quan; Nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu để sản xuất, lắp ráp trang thiết bị y tế; Nguyên liệu, vật tư, linh kiện nhập khẩu phục vụ trực tiếp cho hoạt động sản xuất sản phẩm công nghệ thông tin, nội dung số, phần mềm; Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu để bảo vệ môi trường; Hàng hóa phục vụ hoạt động in, đúc tiền; Miễn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa không nhằm mục đích thương mại; Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu để phục vụ đảm bảo an sinh xã hội, Khắc phục hậu quả thiên tai, thảm họa, dịch bệnh và các trường hợp đặc biệt khác; Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu theo điều ước quốc tế, hàng hóa có trị giá tối thiểu, hàng hóa gửi qua dịch vụ chuyển phát nhanh.

Nghị định này có hiệu lực thi hành từ ngày 01 tháng 9 năm 2016 và thay thế Nghị định số 87/2010/NĐ-CP ngày 13 tháng 8 năm 2010 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành một số điều Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu.

Bãi bỏ quy định về miễn thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu tại các Quyết định: số 31/2015/QĐ-TTg ngày 04 tháng 8 năm 2015, số 52/2015/QĐ-TTg ngày 20 tháng 10 năm 2015, số53/2013/QĐ-TTg ngày 13 tháng 9 năm 2013 và Điều 7 Quyết định số 219/2009/QĐ-TTg ngày 01 tháng 10 năm 2009 của Thủ tướng Chính phủ.